Disciplinas obrigatórias
| Disciplina | Créditos Teóricos | Carga horária |
| Bioestatística | 4 | 60 |
| Ecologia de Comunidades | 3 | 45 |
| Ecologia de Ecossistemas | 3 | 45 |
| Ecologia de Populações | 3 | 45 |
| Métodos de Campo em Ecologia | 4 | 60 |
| Seminário em Sistemas Aquáticos Tropicais I | 3 | 45 |
| Seminário em Sistemas Aquáticos Tropicais II | 3 | 45 |
Disciplinas optativas
| Disciplina | Créditos Teóricos | Carga horária |
| Ambientes Aquáticos Continentais: Diversidade, Importância Ecológica e Econômica e Principais Impactos | 4 | 60 |
| Biogeoquímica Aquática | 4 | 60 |
| Cadeias Microbianas em Ambientes Aquáticos | 3 | 45 |
| Condicionantes Naturais em Bacias Hidrográficas | 4 | 60 |
| Dinâmica de Nitrogênio e Carbono em Ecossistemas Aquáticos Tropicais: uma abordagem isotópica | 3 | 45 |
| Ecologia de Áreas Marinhas Protegidas | 3 | 45 |
| Ecotoxicologia e Biomonitoramento | 4 | 60 |
| Geoprocessamento Aplicado à Gestão de Recursos Marinhos | 3 | 45 |
| Insetos Aquáticos | 4 | 60 |
| Metodologia da Pesquisa Científica | 3 | 45 |
| Métodos Analíticos Aplicados a Ambientes Aquáticos | 4 | 60 |
| Bioindicadores como Ferramentas para Avaliação de Impactos Ambientais em Ecossistemas Aquáticos. | 4 | 60 |
| Introdução ao Uso do software R em Análises Estatísticas | 4 | 60 |
| Poluição Aquática | 4 | 60 |
| Produção Primária e Secundária Aquática | 3 | 45 |
| Redação Científica | 3 | 45 |
| Uso de Ferramentas de Análise de Dados Científicos | 4 | 60 |
| Uso e Conservação de Recursos Aquáticos | 3 | 45 |
| Tópicos especiais em Sistemas Aquáticos Tropicais I | 2 | 30 |
| Tópicos especiais em Sistemas Aquáticos Tropicais II | 3 | 45 |
Atividades Obrigatórias
| Atividade | Crédito (Estágio) | Carga Horária |
| Defesa de Dissertação | Sem | Sem |
| Estágio de Docência | 1 | 45 |
| Exame de Qualificação | Sem | Sem |
| Pesquisa Orientada | Sem | Sem |
Atividade optativa
| Atividade | Créditos | Carga Horária |
| Seminário em Sistemas Aquáticos Tropicais III | Sem | Sem |